a w jakiej rodzielczości robisz capturing ? standard VHS to zaledwie 352x288 i przy rozciąganiu do rozmiarów DVD/SVCD mogą się pojawić błędy. i jakiego softu uzywasz do do zgrywania materiału na HDD ? kodujesz odrazu do mpeg1/2 - jeżeli tak to jakim programem.
może spróbuj złapać najpierw jako "czyste" avi a potem skompresować to dobrym programem/encoderem do mpeg2.
może zajrzyj tutaj:
http://www.divx-digest.com/articles/vhs_capture.html bo ja się na zabawie VHS-DVD kiepsko znam.
co do wyciągania video z vobów to Vobedit robi to napewno. otwierasz pierwszego voba (chyba, że masz tylko jednego), klikasz przycisk DEMUX i zaznaczasz opcje MPEG Stream i ewentualnie Demux Complete Title Set, żeby wypruł video, że wszystkich vobów tworzących dany film. to samo z audio.