Czy jeden moduł jest przypadkiem dwustronny, a jeden - jednostronny ?
Niektóre płyty i chipsety tego nie lubią. Jeśli pamięci są właśnie takie, spróbuj upgrade'u BIOSu.
Jeszcze jeden pomysł.
Jeśli masz timing by SPD, to przecież oba moduły zgłaszają różne parametry.

Płyta może zgłupieć, jeśli nie ma dobrze napisanego BIOSu - z zdarza się to nader często. Ustaw parametry ręcznie na najmniej agresywne wartości z tych, które zgłaszają obie kości i sprawdź.