Emulator (w tej roli jak rozumiem PCSX2 lub któryś jego branch) nie jest dobrym środowiskiem do testów, zbyt wiele różnych konfiguracji i zbyt słaba jest ta emulacja.
Jeśli na swoim PC odczytał tą grę bez problemów to znaczy, że ma ją 1:1, najwyraźniej nagrał na jakimś badziewiu jakimś badziewiem.
- - -
To zależy do czego Ci potrzebne "przerobienie" (nie używaj tego sformułowania. Do konsoli lutuje się modchip lub ją exploituje - na pewno nie przerabia...).
Poczytaj sobie PS2 FAQ.