Z tego co opisujesz to właśnie nie "jest ewidentny problem z systemem", skoro dzieje się tak dopiero po wgraniu wszystkich programów. Przywróć obraz, powgrywaj sterowniki jeśli w nim ich nie ma, potem po kolei wrzucaj to czego potrzebujesz i testuj. Pali zasugerował problem z Winampem, sprawdzałeś ten trop?
Tym bardziej, że jak napisałeś nie używasz programu antywirusowego (w takim razie czy firewalla i uprawnienia poustawiałeś? Czy Windows Defender jest włączony? Czy aktualizujesz system?). Może być tak, że złapałeś jakiś syf i to on narobił Ci problemów.
Za "upierdliwki" odpowiada UAC, wyłącz go lub dostosuj.
BTW: Rób więc obrazy z już skonfigurowanym systemem albo trzymaj sobie ze dwa, goły i grzebany albo programy portablowe. Serio, dziś już nikt nie stawia systemu od nowa.