Może miałeś ukryte pliki? Warto by było zrobić jednak podsumowanie co ile zajmuje (du -ch zamiast du -hr
).
To polecenie podaje rozmiar dla każdego katalogu z podsumowaniem. Potem w Excelu ładnie sobie sortujesz po rozmiarze i nazwie katalogu i wszystko by było jasne.