Nie wiem czy ISO9660 ma atrybut "systemowy", w końcu specyficzny dla FAT i NTFS. Ma jednak atrybut H (hide), który można bez problemu ustawić (w nero prawym klawiszem myszy) i który winda traktuje jako plik "ukryty".
Użytkownicy, którzy potrafią przestawić widok na pliki ukryte, przestawią takze na pliki systemowe - więc daj H i po problemie.
Pomyśl też może o zaszyfrowaniu plików i podaniu hasła w README.txt - pewniejsza metodai i tylko advanced sobie poradzą. Albo o jakimś własnym interfejsie - bo chodzi Ci chyba o czytelność zestawu, w końcu nikt niczego z CD przez niewiedzę nie skasuje