Teoretycznie wszystko wskazuje na YLOD (być może naruszyłeś CPU/GPU podczas wymiany pasty) ale wtedy powinna pojawić się żółta dioda. Może winna jest ta brakująca śrubka?
Takie objawy występują gdy PS3 się przegrzewa (wyłączenie, pikanie + pulsująca czerwona dioda). Spróbuj ją jeszcze raz rozkręcić i podłączyć wszystko "poza" obudową - może coś gdzieś powoduje zwarcie.