Doszedłem już do tego jak to zrobić.
Nie używałem sposobu podanego przez Cobrę bo był dla mnie zbyt trudny
Zrobiłem to jednak Grapheditem
Zaraz za Matrix Mixerem dodałem filtr Wav destination i file writer.
Uzyskałem bardzo ładnego 6 - kanałowego Wav'a tylko z poprzestawianymi kanałami. Użyłem więc potem Soft Encode do którego załadowałem Wav'a, odpowiednio (mam nadzieję) poprzestawiałem kanały i zakodowałem do AC3 - dla mnie efekt końcowy był więcej niż zadowalający.
Dzięki za pomoc i pozdrawiam wszystkich