Ja bym zostawił przeplot. Telewizory wyświetlają obraz z przeplotem (chyba, że masz progressive-scanning). Różnica? hmm jak źle usuniesz przeplot to będzie paskudnie skakać (?). Inna rzecz, że źle przekodowany materiał z przeplotem (nie tam ramka pierwsza) będzie wyglądał co najmniej tak samo źle. Dodatkowo zamieszanie wprowadza flaga TTF w CCE (chyba tak się nazywa - w każdym razie w większości przypadków materiału z interlacem powinna być odhaczona).
Zastrzegam jednak, że istnieje spora szansa, że większość powyższego wywodu to stek bzdur