Ten problem jest tylko przy przewijaniu? Czy w ogóle przy próbie oglądania? Moim skromnym zdaniem to nie ma prawa działać. Skoro film był w VTS 02 a po przeróbce jest w VTS 01 to wszelkie odwołania w menu dotyczące filmu odnoszą się do VTS 02 (chyba, że czegoś nie zrozumiałem w Twoim poście).
Co z tym można zrobić? Przede wszystkim zmienć nazwy plików wygenerowanych przez DVD2DVD-R z VTS_01_* na VTS_02_*. Skopiować z oryginalnej płytki VTS_01_* do tego samego katalogu. Uruchomić TitleSetBlanker'a i wyczyścić VTS_01_* (zostaną wówczas pliki o wielkości 10KB). Wczytać dowolne IFO do IfoEdit'a i zrobić Get VTS Sectors. Całość zgrać na dvd-rw i sprawdzić na stacjonarnym odtwarzaczu. Jeśli nie będzie działać to pewnie trzeba jeszcze raz wykonać krok z IfoUpdate'm (po zmianie nazwy na VTS_02 a przed TitleSetBlankerem). Good Luck! (you'll gonna need it
)