Praktycznie rzecz ujmując nie da się tego zrobić.
Jest co prawda programik submux-dvd ale pod unix'a tylko (to akurat nie jest jakaś wada z mojego punktu widzenia) i zmuszenie go do poprawnego działania jest słabo możliwe

Musisz rozbić VOBy i dołożyć napisy na etapie authoringu DVD.
Jak to zrobić?
Tu znajdziesz