Proponuję użyć do obcinania softu z tej samej stajni: Tmpgenc (w skrócie: uruchamiasz Tmpgenc, zamykasz kreatora następnie file opcja MPEG Tools... Merge & Cut dalej powinieneś sobie poradzić bez problemów) natomiast TMPGEnc DVD Author możesz zrobić athoring i wypalić to później w nero.
