Na pewno masz płytkę od tej płyty. Praktycznie do każdej płyty dodają cd ze steronikami lub innym badziewiem typu manual w PDFie. Zazwyczaj są tam też sterowniki do chipsetu płyty głównej, nowsze niż w windowsie. Pewnie są też na stronie producenta. Instalowałeś to? Ja mam np. chipset i820 i na stronie intela jest tam coś do tego chipsetu nazywa się intela ulstra ata storaeg driver. To jest chyba do kontrolera płyty, ale zauważyłem, że lepiej działa po instalacji tego badziewia.
Możesz też wysłac maila po angielsku

do MSI support, może odpiszą
PS. Nawet gdyby płyta nie miała fizycznie wyjścia isa to kontroler i tak musi być, a to chyba z nim jest problem...