Prawdopodobnie boot sector był zapisany w obrazie partycji. Nie wiem jakim sposobem działa ci ten obraz na innym dysku (pewnie się naprawiał albo to zasługa najnowszego Ghosta).Najlepszym rozwiązazniem jest wg mnie wrócenie starego dysku na system (i zrobienie obrazu bez boot sectora jeśli koniecznie chcesz mieć sys na nowym), inne działania są troche ryzykowne.
Ps. Zawsze mozna zrobić obraz od nowa (po jednym dniu(min) zabawy mozna naprawde piekny "ułożony" systemik sobie zmontować
)