Robisz dobrze

To ja nie wziąłem pod uwagę faktu, że te klipy ktoś powycinał ze środka jakiś koncertów. I dlatego Shrink głupieje.
Trzeba go zastąpić programem TMPGEnc DVD Author - w opcji Add DVD-Video powinien wczytać te klipy bez problemu.
Metoda, którą podał Staszek666 najprawdopodobniej wyłoży się z takiego samego powodu, co Shrink. Trzeba by w niej zrobić restream plików m2v i poprawę plików audio, a to już trochę więcej roboty...