Można.
Najpierw trzeba rozłożyć dvd na oddzielne strumienie (np. Vobedit) - wideo, audio (dts) +ew. napisy, jeśli są. Jeśli masz gotową drugą ścieżkę audio w np. AC3, to wystarczy zrobić ponowny authoring w np. ifoEdit, dodając nowe audio.
Jeśli chcesz się bawić z tym DTS, to możesz rozłożyć go na oddzielne 6 kanałów w postaci plików wav za pomocą programu HyperCube Transcoder (
http://hypercube.is.dreaming.org/). Jak zrobić później z tego AC3 możesz poczytać tu
http://www.cdrinfo.pl/artykuly/20to51/strona6.php
A dalej, jak wyżej, ponowny authoring w ifoEdit.