Ok, to spróbuj może tak:
tworzysz plik cron-hourly.php i umieszczasz go w katalogu głównym (zgodnie z dokumentacją home.pl:
http://home.pl/pomoc/funkcje/cgi/cron)
Wewnątrz dajesz:
Kod:
<?php
exec('perl /sciezka/do/pliku/plik.pl')
?>
Powinno zadziałać, o ile nie jest zablokowane wykonywanie execa.